斯坦福大学生命科学类科研项目简介
Stanford FResearch
一、 学校简介
斯坦福大学在多个国内外大学排名中均在十强之列。其中,世界大学学术排名( ARWU )更是多 年来都一直将其列作世界第二。斯坦福大学内各个学科在世界排名均处于领先地位,尤其在统计与 运筹学、电气工程学、计算机科学、生物医学、商学、社会科学等多个学科领域拥有世界级的学术 影响力。
二、 项目简介
生命科学是一门有很长历史的学科。从人类文明的初期直至现在,人们都没有停止对生命相关科 学的探索,现代生命科学不仅有不同于传统生物学的许多特点,而且深刻影响着现代科学的各个领 域,成为多学科相互渗透,并且衍生出了一系列的分支学科和边缘学科。如研究基因及其基因表达 的分子遗传学,研究生物大分子的结构与功能、生物体内化学变化的生物化学,以及生物物理学、 生物数学、生物力学、生物光学、生物医学、农业生物学环境生物等,甚至生命科学的研究,还涉 及到电子计算机、人工智能、工程控制论等现代科学技术的研究领域。
2018 年 国庆期间,诺贝尔奖化学奖、物理学奖、生理学或医学奖揭晓,自然科学三 大 奖项均和生 命科学有关,为什么生命科学、医学、化学和物理学的交叉学科成果最容易受到诺贝尔奖的青睐? 答案是比较清晰的,交叉学科是比较容易出成果的富矿,而且学科交叉更容易获得突破性的发现和 发明。从 2000 年以来, 18 次诺贝尔化学奖有 12 次颁给了生命科学相关领域,也因此被不少人戏称为 “ 诺贝尔理综奖 ” 。
由此可见 未来 的研究和发展 都是 围绕在 生物、化学、材料、物理、数学、人工智能 和工程等 交叉综合 领域 , 跨学科 共同开展研究已经成为了常态。本次科研项目是基于斯坦福大学生物医学类学生培养体系而精炼而来,旨在让学生对现代生物医 学的概念和技术有一个全面而详尽的了解, 在导师的带领下 对生物医学研究的最前沿 科学 进行学习和 讨论,在科研中学生有机会接触到最新的生物医学技术及其在现实生活中的应用。在科研完成后,学生了解 到 生物医学研究的整体流程和框架,并对现代生物医学技术 发展 有 清晰 的 认识,对学生以后选择未来的专业和人生规划提供帮助。
三、项目说明 面向对象:欲以申请美国常青藤名校生命科学、生物技术、生物信息、医学统计、医学数学等生物 医学类相关专业的本科生、研究生为主、或医生访问学者;
科研主题:以下领域内的相关课题,具体课题根据学生的基础,导师面试后确定。
Biomedical Engineering and Sciences [生物医药工程]
Biological Sciences [生物医药科学]
Applied Physics [应用物理]
Neuroscience [神经科学]
Biophysics [生物物理学]
Molecular Imaging [分子成像] 软性背景:有一定的科研履历者优先;
科研导师:斯坦福大学生命科学类专业导师;
科研地点:斯坦福大学科研组教室等教学场所;
科研时间:
时间:寒暑假期间,每期时间长度为 3—4 周;
(针对假期不足 4 周的同学,可采取实地 + 远程相结合的方式,确保科研收获,如果科研时期还未获 得美国签证的同学,也可采取直接远程的方式进行学术科研)
具体情况根据学生面试情况由美方进行调整;报名后安排校方面试,面试前辅导学生阅读 1 篇专业论 文;
四、 选拔流程
1. 提交报名表;
2. 初审合格,签订协议,科研组择优面试;
3. 面试通过后,发送录取确认书;
4. 协调机票、接机、住宿;
5. 赴美开始科研;
6. 丰富的 CV 、 PS 履历;获得科研证书,表现优异者可获导师推荐信助力申请。
五、科研收获
1 、 进入美国顶尖名校,师从名校导师开展科研项目;接触尖端科学;
2 、 为未来在美深造做准备;留美经历是美国申研的基石,顶级名校的科研项目是对你有能力完成名 校的申请
和学习的最好证明。
3 、 高层次的人脉和校友关系,与你为伍的人是世界顶级名校的专家、学者,你将体验到世界最顶级 学术专家
们的思想和气质。
4 、 挑战自身潜能,切身体会斯坦福大学顶尖科研环境,在严苛的训练下快速成长。
5 、 极大拓宽视野,实地感受国内外科研区别。通过此次科研,参与学生将会对留学名校有个清晰的 认识,并
依此做出最优的人生规划。
6 、 有机会获得美方导师推荐信;一封有分量的推荐信,高含金量收获助力未来留学深造及就业。
7 、 美国当地的旅游和个人成长。
附件:课题计划范例
Population analysis of memory-related neural ensemble
Keywords: Neural Ensemble, Memory, Calcium Imaging, Decoding
Summary
The system neuroscience field has transitioned from single cell recordings to high through-put
monitoring of hundreds or even thousands of neurons simultaneously. The interpretation of these
large data sets requires deep understanding of the psychological nature of related behavior, as well as
the rigorous application of relevant statistical techniques. In this project, we will explore a large data
set of cortical neuronal activity recorded during mice performing a memory-guided task by calcium
imaging. We will use population vector, mutual information, and some machine learning techniques
to identify memory-related activity and decode the animal's behavior. We will design analyses
pipelines and try to distinguish neural signature of different psychological constructs.
Students will learn
--How to open, browse, and process large (individual file over 100Gb) image files.
--How to use shuffled data to generate null hypothesis to test signal specificity.
--How to use population vector to describe the real-time ensemble activity in various task-relevant
axis.
-- How to construct, cross-validate and test decoders to interpret neural ensemble activity.
-- How to design biological experiments to test the causality suggested by analyses.
Pre-requisite
--Neuroscience: Students should understand the classic rodent behavioral tasks for short-term and
long-term memory, such as contextual or cued fear conditioning and delayed discrimination.
--Statistics: Students should understand the principles of hypothesis testing and being able to
articulate the interpretation of a statistical test results. Students are expected to be familiar with
common parametric and non-parametric tests.
--Programming: Students should be able to understand basic Matlab scripts.
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Spikes: Exploring the Neural Code (Computational Neuroscience)
by Fred Rieke (Author), David Warland (Author), Rob de Ruyter van Steveninck (Author), William
Bialek (Author), Terrence J. Sejnowski (Editor), Tomaso A. Poggio
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